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Python使用Py2neo創建Neo4j的節點和關系

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Neo4j是一款開源圖數據庫,使用Python語言訪問Neo4j可以使用Py2neo。本文介紹了使用Py2neo訪問Neo4j,批量創建節點和關系的方法。Py2neo提供了直接執行Cypher語句的方法,也提供了諸如Node、Relationship、Path一系列的數據結構,在不同的場景下可以靈活使用。

​本文使用的Py2neo是2021.1之后的版本,手冊請戳這里:
The Py2neo Handbook

一、安裝Py2neo

使用pip安裝Py2neo,執行:

pip install py2neo

查看已安裝的Py2neo是什么版本的:

pip show py2neo

二、連接Neo4j數據庫

本文中會用到多種數據類型,在此一并引用

import numpy as np
import pandas as pd
from py2neo import Node,Relationship,Graph,Path,Subgraph

配置Neo4j數據庫的訪問地址、用戶名和密碼

neo4j_url = '訪問地址'
user = '用戶名'
pwd = '密碼'

在此時間段之前訪問數據庫的方式為:

graph = Graph(neo4j_url, username=user, password=pwd)

在此時間段之后的版本訪問數據庫的方式為(就是這么不兼容):

graph = Graph(neo4j_url,  auth=(user, pwd))

1. 使用graph.run執行Cypher語句創建節點

如果熟悉Cypher語句的話,可以通過使用graph.run執行Cypher語句來實現創建節點等操作,方法如下所示:

cypher_ = "CREATE (:Person {name:'王王', age:35, work:'腳本之家}),\

(:Person {name:'李李', age:20, work:'腳本之家})"
graph.run(cypher_)

這樣就在Neo4j中創建了兩個label為Person的節點,第一個節點的name屬性為“王王”,age屬性為35,work屬性為“腳本之家”,第二個節點的name屬性為“李李”,age屬性為20,work屬性為“宇腳本之家”。

同樣,可以通過調用graph.run執行Cypher語句創建關系。

cypher_ = "MATCH (from:Person{name:'王王'}),\

(to:Person{name:'李李'}) MERGE (from)-[r:同事]->(to)"
graph.run(cypher_)

這樣在Neo4j中就有了具有同事關系的兩個Person節點。

2. 使用Node數據結構創建節點

Py2neo也提供graph.create方法來創建節點和關系

node = Node("Person", name="李李", age=20, work="腳本之家")
graph.create(node)

與執行Cypher語句的效果相同,在Neo4j中創建了一個Person節點。

需要注意的是,這兩種創建方法,如果反復執行的話,是會在Neo4j中創建出重復的節點的,即name、age、work屬性完全一樣,但在Neo4j中的id不一樣的多個節點。

3. 使用Node、Relationship和Subgraph數據結構創建節點和關系

上面兩種方法都是一次創建一個節點或者一個關系,Py2neo也提供了批量創建節點和關系的方法,而且性能更優。下面就以下圖中的圖譜為例,使用Py2neo提供Node、Relationship和Subgraph數據結構在Neo4j中創建節點和關系。

首先創建一些label為Person的節點,即Node對象,第一個參數是label,屬性按key=value依次作為參數傳入。如果節點有多個label,可以用Node.add_label("label_text")來追加label。

node1 = Node("Person", name="王王", age=35, work="腳本之家")
node2 = Node("Person", name="李李", age=20, work="腳本之家")
node3 = Node("Person", name="張張", age=30, work="腳本之家")
node4 = Node("Person", name="趙趙", age=45, work="月亮中學")
node4.add_label("Teacher")
node5 = Node("Person", name="劉劉", age=20, work="地球電子商務公司")

再創建一些label為Location的節點

node6 = Node("Location", name="南京") 
node7 = Node("Location", name="江寧區") 
node8 = Node("Location", name="祿口機場") 

建立一些Person和Person節點之間的關系,Neo4j中的關系是有方向的,所以Relationship第一個參數為起始節點,第三個參數是結束節點,而第二個節點為關系的類型。這里創建的同事、鄰居的關系為雙向的,老師、學生的關系為單向。

relation1 = Relationship(node1, "同事", node2)
relation2 = Relationship(node2, "同事", node1)

relation3 = Relationship(node2, "同事", node3)
relation4 = Relationship(node3, "同事", node2)

relation5 = Relationship(node3, "鄰居", node4)
relation6 = Relationship(node4, "鄰居", node3)

relation7 = Relationship(node4, "學生", node5)
relation8 = Relationship(node5, "老師", node4)

創建一些Location和Location節點之間的關系,地域之間的包含關系為單向。

relation9 = Relationship(node6, "包含", node7)
relation10 = Relationship(node7, "包含", node8)

創建Person節點和Location節點之間的關系,這里“到訪”的關系是有屬性的,date表示到訪的日期,stay_hours表示停留的時間。可以使用一個key:value的字典數據結構保存屬性,再賦予關系

properties1={'date':'2021-7-16','stay_hours':1}
relation11 = Relationship(node2, "到訪", node8, **properties1)

properties2={'date':'2021-7-19','stay_hours':4}
relation12 = Relationship(node5, "到訪", node8, **properties2)

然后將以上所有節點和關系組成Subgraph

node_ls = [node1, node2, node3, node4, 
           node5, node6, node7, node8]
relation_ls = [relation1, relation2, relation3, relation4, 
               relation5, relation6, relation7, relation8, 
               relation9, relation10, relation11, relation12]
subgraph = Subgraph(node_ls, relation_ls)

最后通過事務類Transaction提交,批量創建這些節點和關系。這里tx.create并沒有真正創建節點和關系,直到graph.commit才一次性提交到Neo4j進行創建。

tx = graph.begin() 
tx.create(subgraph)
graph.commit(tx)

重復執行上面的命令,不會創造出重復的節點和關系。這一點手冊中有說明:“subgraph中的已經和數據庫綁定的實體將保持不變,那些沒有綁定的將在數據庫中新建并綁定上。”

create(subgraph) Create remote nodes and relationships that correspond to those in a local subgraph. Any entities in subgraph that are already bound to remote entities will remain unchanged, those which are not will become bound to their newly-created counterparts.

三、性能對比

做一個簡單的實驗粗略地對比逐個創建和批量創建的時間開銷。在Neo4j為空數據庫的情況下,分別采用逐個創建和批量創建的方法創建10000個節點,每個節點有name和age兩個屬性,都是隨機生成的,使用jupyter notebook的%%time命令計算時間開銷。

import random
N = 10000

逐個創建節點:

%%time
for i in range(N):
    random_name = "P"+str(round(random.random()*N*2))
    random_age = round(random.random()*15)
    node = Node("Person", name=random_name, age=random_age)
    graph.create(node)

CPU times: user 50.3 s, sys: 4.19 s, total: 54.5 s
Wall time: 5min 16s

批量創建節點:

%%time
node_ls = []
for i in range(N):
    random_name = "P"+str(round(random.random()*N*2))
    random_age = round(random.random()*15)
    node = Node("Person", name=random_name, age=random_age)
    node_ls.append(node)

subgraph = Subgraph(node_ls, [])
tx = graph.begin() 
tx.create(subgraph)
graph.commit(tx)

CPU times: user 448 ms, sys: 75.5 ms, total: 523 ms
Wall time: 1.46 s

實驗中也發現,只是創建節點的話,批量創建方法的時間開銷幾乎是線性增長的,當一次性提交10萬個節點的創建任務時,時間開銷大約在4.5秒。
在使用Py2neo構建圖譜時,盡可能使用批量創建方法。先創建節點(Node)對象、關系(Relationship)對象,再構成子圖(Subgraph),最后利用事務類一次提交創建。
下一篇將介紹如何運用Py2neo查詢節點、關系和路徑。

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