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python+opencv圖像分割實現分割不規則ROI區域方法匯總

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在圖像分割領域,一個重要任務便是分割出感興趣(ROI)區域。如果是簡易的矩形ROI區域其實是非常容易分割的,opencv的官方python教程里也有教到最簡易的矩形ROI分割(剪裁),其本質是多維數組(矩陣)的切片。但是現實情況中,ROI是不規則的多邊形,也可能是曲線邊界,那么該如何分割出來呢?下面總結幾種思路。

可能只提供核心部分的代碼示例,具體應用要結合你自己的項目來修正。

一、已知邊界坐標,直接畫出多邊形

例:最基礎的畫個四邊形

# 定義四個頂點坐標
pts = np.array([[10, 5],  [50, 10], [70, 20], [20, 30]], np.int32)
# 頂點個數:4,矩陣變成4*1*2維
# OpenCV中需要將多邊形的頂點坐標變成頂點數×1×2維的矩陣
# 這里 reshape 的第一個參數為-1, 表示“任意”,意思是這一維的值是根據后面的維度的計算出來的
pts = pts.reshape((-1, 1, 2))
cv2.polylines(img, [pts], True, (0, 255, 255))

上例中,img是你的畫布原圖。pts你可以隨便改,改成自己的邊界點。注意cv2.polylines中參數pts要加[ ]。

二、通過形態學操作產生Mask

腐蝕、膨脹之后,產生二值化(非黑即白)的mask,然后和圖像做與運算。

腐蝕膨脹的操作方法簡單復習一下:

kernel = cv2.getStructuringElement(cv2.MORPH_ELLIPSE, (10, 10))  # 矩形結構:MORPH_RECT
kernel1 = cv2.getStructuringElement(cv2.MORPH_RECT, (15, 15))  # 橢圓結構:MORPH_ELLIPSE
img = cv2.erode(img, kernel)  # 腐蝕 
img = cv2.dilate(img, kernel)  # 膨脹

我們都知道,腐蝕膨脹完后會得到一個二值化的掩模(mask)。

    mask = cv2.cvtColor(img, cv2.COLOR_GRAY2BGR) #img是腐蝕膨脹完的圖片
    ROI = cv2.bitwise_and(mask, oriimg) #oriimg是原始圖片
    cv2.imshow('ROI',ROI)
    if cv2.waitKey(500) and 0xff == ord('q'):
        cv2.destroyAllWindows()

 講原始圖片和mask做一個掩模就可以得到最終圖像了(例子此處就不舉了因為一些圖片涉及科研內容,paper還未發表,請自行試一下吧)。

三、人機交互式

用鼠標點擊,產生多邊形。

這樣是比較精確的,比較是人工操作,但是比較麻煩,如果有上萬張圖片,你不可能每張都自己鼠標去分割出來一下。但是這個方法可以用于獲取ROI的ground-truth,然后用來和機器分割的結果做對比,計算準確率、召回率等評價指標!所以學一下還是有用的。

#!/usr/bin/env python3
# -*- coding: utf-8 -*-
"""
Created on Wed May 29 19:18:28 2019
@author: youxinlin
"""
 
import cv2
import numpy as np
 
# -----------------------鼠標操作相關------------------------------------------
lsPointsChoose = []
tpPointsChoose = []
pointsCount = 0
count = 0
pointsMax = 6
def on_mouse(event, x, y, flags, param):
    global img, point1, point2, count, pointsMax
    global lsPointsChoose, tpPointsChoose  # 存入選擇的點
    global pointsCount  # 對鼠標按下的點計數
    global img2, ROI_bymouse_flag
    img2 = img.copy()  # 此行代碼保證每次都重新再原圖畫  避免畫多了
    # -----------------------------------------------------------
    #    count=count+1
    #    print("callback_count",count)
    # --------------------------------------------------------------
 
    if event == cv2.EVENT_LBUTTONDOWN:  # 左鍵點擊
        pointsCount = pointsCount + 1
        # 感覺這里沒有用?2018年8月25日20:06:42
        # 為了保存繪制的區域,畫的點稍晚清零
        # if (pointsCount == pointsMax + 1):
        #     pointsCount = 0
        #     tpPointsChoose = []
        print('pointsCount:', pointsCount)
        point1 = (x, y)
        print (x, y)
        # 畫出點擊的點
        cv2.circle(img2, point1, 10, (0, 255, 0), 2)
 
        # 將選取的點保存到list列表里
        lsPointsChoose.append([x, y])  # 用于轉化為darry 提取多邊形ROI
        tpPointsChoose.append((x, y))  # 用于畫點
        # ----------------------------------------------------------------------
        # 將鼠標選的點用直線連起來
        print(len(tpPointsChoose))
        for i in range(len(tpPointsChoose) - 1):
            print('i', i)
            cv2.line(img2, tpPointsChoose[i], tpPointsChoose[i + 1], (0, 0, 255), 2)
        # ----------------------------------------------------------------------
        # ----------點擊到pointMax時可以提取去繪圖----------------
 
        cv2.imshow('src', img2)
        
# -------------------------右鍵按下清除軌跡-----------------------------
    if event == cv2.EVENT_RBUTTONDOWN:  # 右鍵點擊
        print("right-mouse")
        pointsCount = 0
        tpPointsChoose = []
        lsPointsChoose = []
        print(len(tpPointsChoose))
        for i in range(len(tpPointsChoose) - 1):
            print('i', i)
            cv2.line(img2, tpPointsChoose[i], tpPointsChoose[i + 1], (0, 0, 255), 2)
        cv2.imshow('src', img2)
 
    # -------------------------雙擊 結束選取-----------------------------
    if event == cv2.EVENT_LBUTTONDBLCLK: 
    # -----------繪制感興趣區域-----------
        ROI_byMouse()
        ROI_bymouse_flag = 1
        lsPointsChoose = []
        
 
def ROI_byMouse():
    global src, ROI, ROI_flag, mask2
    mask = np.zeros(img.shape, np.uint8)
    pts = np.array([lsPointsChoose], np.int32)  # pts是多邊形的頂點列表(頂點集)
    pts = pts.reshape((-1, 1, 2))
    # 這里 reshape 的第一個參數為-1, 表明這一維的長度是根據后面的維度的計算出來的。
    # OpenCV中需要先將多邊形的頂點坐標變成頂點數×1×2維的矩陣,再來繪制
 
    # --------------畫多邊形---------------------
    mask = cv2.polylines(mask, [pts], True, (255, 255, 255))
    ##-------------填充多邊形---------------------
    mask2 = cv2.fillPoly(mask, [pts], (255, 255, 255))
    cv2.imshow('mask', mask2)
    cv2.imwrite('mask.jpg', mask2)
    image,contours, hierarchy = cv2.findContours(cv2.cvtColor(mask2, cv2.COLOR_BGR2GRAY), cv2.RETR_TREE, cv2.CHAIN_APPROX_NONE)
    ROIarea = cv2.contourArea(contours[0])
    print("ROIarea:",ROIarea)
    ROI = cv2.bitwise_and(mask2, img)
    cv2.imwrite('ROI.jpg', ROI)
    cv2.imshow('ROI', ROI)
 
img = cv2.imread('3.png')
# ---------------------------------------------------------
# --圖像預處理,設置其大小
# height, width = img.shape[:2]
# size = (int(width * 0.3), int(height * 0.3))
# img = cv2.resize(img, size, interpolation=cv2.INTER_AREA)
# ------------------------------------------------------------
ROI = img.copy()
cv2.namedWindow('src')
cv2.setMouseCallback('src', on_mouse)
cv2.imshow('src', img)
cv2.waitKey(0)
cv2.destroyAllWindows()

你可以增加更多的功能。。。附:鼠標點擊事件 :

'''
EVENT_FLAG_ALTKEY = 32  摁住Alt
EVENT_FLAG_CTRLKEY = 8  摁住Ctrl
EVENT_FLAG_LBUTTON = 1  摁住左鍵
EVENT_FLAG_MBUTTON = 4  摁住中鍵
EVENT_FLAG_RBUTTON = 2  摁住右鍵
EVENT_FLAG_SHIFTKEY = 16 摁住Shift
EVENT_LBUTTONDBLCLK = 7  左鍵雙擊
EVENT_LBUTTONDOWN = 1  左鍵擊下
EVENT_LBUTTONUP = 4   左鍵彈起
EVENT_MBUTTONDBLCLK = 9  中鍵雙擊
EVENT_MBUTTONDOWN = 3  中鍵擊下
EVENT_MBUTTONUP = 6   中鍵彈起
EVENT_MOUSEHWHEEL = 11  滾動條向左,flags>0。向右,flags0
EVENT_MOUSEMOVE = 0   鼠標移動
EVENT_MOUSEWHEEL = 10  滾動條向上,flags>0。向下,flags0
EVENT_RBUTTONDBLCLK = 8  中鍵雙擊
EVENT_RBUTTONDOWN = 2  中鍵擊下
EVENT_RBUTTONUP = 5   中鍵彈起
'''

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